Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms