Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms