Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms