Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKOR1P84550 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR1P84550 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms