Protein–RNA interactions for Protein: P80162

CXCL6, C-X-C motif chemokine 6, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL6P80162 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CXCL6P80162 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CXCL6P80162 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms