Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL8P80075 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL8P80075 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL8P80075 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL8P80075 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL8P80075 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL8P80075 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL8P80075 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL8P80075 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL8P80075 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL8P80075 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL8P80075 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL8P80075 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms