Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX6P78412 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX6P78412 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX6P78412 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX6P78412 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX6P78412 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX6P78412 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX6P78412 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX6P78412 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX6P78412 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX6P78412 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX6P78412 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX6P78412 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX6P78412 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX6P78412 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX6P78412 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX6P78412 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX6P78412 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX6P78412 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX6P78412 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX6P78412 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX6P78412 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX6P78412 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX6P78412 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX6P78412 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX6P78412 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX6P78412 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX6P78412 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX6P78412 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX6P78412 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX6P78412 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX6P78412 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX6P78412 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX6P78412 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX6P78412 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX6P78412 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX6P78412 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX6P78412 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX6P78412 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX6P78412 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX6P78412 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX6P78412 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX6P78412 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX6P78412 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX6P78412 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX6P78412 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX6P78412 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX6P78412 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX6P78412 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX6P78412 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX6P78412 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX6P78412 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX6P78412 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX6P78412 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX6P78412 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX6P78412 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX6P78412 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX6P78412 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX6P78412 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX6P78412 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX6P78412 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX6P78412 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX6P78412 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX6P78412 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX6P78412 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX6P78412 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX6P78412 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX6P78412 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX6P78412 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX6P78412 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX6P78412 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX6P78412 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX6P78412 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX6P78412 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX6P78412 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX6P78412 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX6P78412 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX6P78412 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX6P78412 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX6P78412 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX6P78412 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX6P78412 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX6P78412 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX6P78412 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX6P78412 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX6P78412 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX6P78412 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX6P78412 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX6P78412 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX6P78412 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX6P78412 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX6P78412 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX6P78412 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX6P78412 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX6P78412 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX6P78412 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX6P78412 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX6P78412 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX6P78412 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX6P78412 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms