Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS28P62857 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS28P62857 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RPS28P62857 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms