Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UFM1P61960 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UFM1P61960 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UFM1P61960 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UFM1P61960 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UFM1P61960 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UFM1P61960 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UFM1P61960 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UFM1P61960 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UFM1P61960 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UFM1P61960 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UFM1P61960 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UFM1P61960 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UFM1P61960 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UFM1P61960 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UFM1P61960 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UFM1P61960 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UFM1P61960 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UFM1P61960 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UFM1P61960 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UFM1P61960 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UFM1P61960 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UFM1P61960 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UFM1P61960 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UFM1P61960 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UFM1P61960 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UFM1P61960 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UFM1P61960 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UFM1P61960 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UFM1P61960 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UFM1P61960 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UFM1P61960 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UFM1P61960 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UFM1P61960 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UFM1P61960 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UFM1P61960 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UFM1P61960 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
UFM1P61960 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UFM1P61960 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UFM1P61960 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UFM1P61960 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UFM1P61960 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UFM1P61960 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UFM1P61960 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UFM1P61960 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UFM1P61960 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UFM1P61960 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UFM1P61960 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UFM1P61960 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UFM1P61960 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UFM1P61960 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UFM1P61960 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UFM1P61960 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UFM1P61960 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UFM1P61960 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UFM1P61960 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UFM1P61960 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UFM1P61960 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UFM1P61960 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UFM1P61960 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UFM1P61960 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UFM1P61960 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UFM1P61960 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UFM1P61960 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UFM1P61960 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UFM1P61960 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UFM1P61960 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UFM1P61960 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UFM1P61960 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UFM1P61960 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UFM1P61960 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UFM1P61960 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UFM1P61960 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UFM1P61960 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms