Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSX2P58304 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSX2P58304 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSX2P58304 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSX2P58304 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSX2P58304 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSX2P58304 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSX2P58304 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSX2P58304 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSX2P58304 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSX2P58304 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSX2P58304 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSX2P58304 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSX2P58304 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSX2P58304 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSX2P58304 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSX2P58304 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSX2P58304 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSX2P58304 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSX2P58304 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSX2P58304 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSX2P58304 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSX2P58304 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSX2P58304 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSX2P58304 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
VSX2P58304 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VSX2P58304 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VSX2P58304 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VSX2P58304 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
VSX2P58304 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VSX2P58304 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VSX2P58304 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSX2P58304 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSX2P58304 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSX2P58304 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VSX2P58304 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSX2P58304 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSX2P58304 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSX2P58304 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VSX2P58304 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSX2P58304 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSX2P58304 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSX2P58304 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSX2P58304 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSX2P58304 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSX2P58304 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSX2P58304 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSX2P58304 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSX2P58304 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSX2P58304 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSX2P58304 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSX2P58304 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSX2P58304 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSX2P58304 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSX2P58304 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSX2P58304 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSX2P58304 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VSX2P58304 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSX2P58304 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSX2P58304 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSX2P58304 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSX2P58304 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSX2P58304 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSX2P58304 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSX2P58304 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSX2P58304 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSX2P58304 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSX2P58304 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSX2P58304 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSX2P58304 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSX2P58304 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSX2P58304 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSX2P58304 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSX2P58304 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms