Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.3■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCKAP1LP55160 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NCKAP1LP55160 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NCKAP1LP55160 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NCKAP1LP55160 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKAP1LP55160 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKAP1LP55160 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKAP1LP55160 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKAP1LP55160 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKAP1LP55160 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKAP1LP55160 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKAP1LP55160 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKAP1LP55160 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKAP1LP55160 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms