Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHBP55084 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHBP55084 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHBP55084 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHBP55084 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHBP55084 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHBP55084 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHBP55084 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHBP55084 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHBP55084 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHBP55084 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHBP55084 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHBP55084 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHBP55084 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHBP55084 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHBP55084 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHBP55084 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHBP55084 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHBP55084 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHBP55084 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHBP55084 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHBP55084 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHBP55084 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHBP55084 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHBP55084 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHBP55084 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHBP55084 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHBP55084 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHBP55084 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHBP55084 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHBP55084 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHBP55084 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHBP55084 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHBP55084 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHBP55084 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHBP55084 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHBP55084 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHBP55084 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHBP55084 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHBP55084 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHBP55084 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHBP55084 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHBP55084 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHBP55084 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHBP55084 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHBP55084 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHBP55084 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHBP55084 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHBP55084 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHBP55084 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHBP55084 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHBP55084 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HADHBP55084 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HADHBP55084 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HADHBP55084 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HADHBP55084 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HADHBP55084 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HADHBP55084 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HADHBP55084 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HADHBP55084 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HADHBP55084 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HADHBP55084 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HADHBP55084 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HADHBP55084 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HADHBP55084 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HADHBP55084 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms