Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MVDP53602 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MVDP53602 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MVDP53602 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MVDP53602 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MVDP53602 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MVDP53602 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MVDP53602 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MVDP53602 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MVDP53602 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MVDP53602 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MVDP53602 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MVDP53602 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MVDP53602 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MVDP53602 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MVDP53602 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MVDP53602 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MVDP53602 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MVDP53602 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MVDP53602 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms