Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETV1P50549 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETV1P50549 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETV1P50549 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETV1P50549 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETV1P50549 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETV1P50549 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETV1P50549 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETV1P50549 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETV1P50549 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETV1P50549 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ETV1P50549 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETV1P50549 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETV1P50549 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ETV1P50549 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETV1P50549 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETV1P50549 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETV1P50549 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETV1P50549 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETV1P50549 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETV1P50549 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETV1P50549 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETV1P50549 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETV1P50549 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETV1P50549 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETV1P50549 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETV1P50549 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETV1P50549 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETV1P50549 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETV1P50549 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETV1P50549 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETV1P50549 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETV1P50549 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETV1P50549 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETV1P50549 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETV1P50549 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETV1P50549 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETV1P50549 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETV1P50549 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETV1P50549 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms