Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms