Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTDSS1P48651 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms