Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCR1P46094 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XCR1P46094 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XCR1P46094 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
XCR1P46094 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XCR1P46094 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XCR1P46094 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XCR1P46094 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XCR1P46094 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XCR1P46094 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XCR1P46094 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XCR1P46094 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XCR1P46094 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XCR1P46094 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
XCR1P46094 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XCR1P46094 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XCR1P46094 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XCR1P46094 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XCR1P46094 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XCR1P46094 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XCR1P46094 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XCR1P46094 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XCR1P46094 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XCR1P46094 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
XCR1P46094 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XCR1P46094 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
XCR1P46094 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
XCR1P46094 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
XCR1P46094 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
XCR1P46094 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
XCR1P46094 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
XCR1P46094 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
XCR1P46094 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
XCR1P46094 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCR1P46094 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XCR1P46094 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XCR1P46094 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XCR1P46094 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XCR1P46094 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XCR1P46094 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XCR1P46094 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XCR1P46094 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XCR1P46094 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XCR1P46094 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms