Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT4P35916 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT4P35916 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT4P35916 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT4P35916 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT4P35916 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT4P35916 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT4P35916 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT4P35916 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FLT4P35916 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FLT4P35916 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FLT4P35916 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FLT4P35916 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FLT4P35916 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FLT4P35916 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FLT4P35916 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FLT4P35916 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FLT4P35916 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FLT4P35916 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FLT4P35916 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FLT4P35916 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FLT4P35916 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FLT4P35916 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FLT4P35916 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FLT4P35916 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FLT4P35916 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FLT4P35916 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FLT4P35916 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FLT4P35916 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FLT4P35916 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FLT4P35916 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FLT4P35916 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FLT4P35916 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FLT4P35916 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FLT4P35916 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FLT4P35916 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FLT4P35916 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FLT4P35916 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FLT4P35916 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FLT4P35916 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FLT4P35916 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FLT4P35916 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FLT4P35916 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FLT4P35916 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FLT4P35916 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FLT4P35916 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FLT4P35916 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FLT4P35916 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FLT4P35916 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FLT4P35916 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FLT4P35916 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FLT4P35916 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FLT4P35916 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FLT4P35916 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FLT4P35916 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FLT4P35916 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FLT4P35916 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FLT4P35916 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FLT4P35916 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FLT4P35916 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FLT4P35916 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FLT4P35916 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FLT4P35916 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FLT4P35916 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FLT4P35916 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FLT4P35916 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FLT4P35916 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FLT4P35916 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FLT4P35916 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FLT4P35916 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FLT4P35916 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FLT4P35916 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FLT4P35916 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FLT4P35916 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FLT4P35916 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FLT4P35916 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FLT4P35916 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FLT4P35916 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FLT4P35916 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FLT4P35916 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FLT4P35916 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FLT4P35916 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FLT4P35916 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FLT4P35916 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FLT4P35916 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FLT4P35916 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FLT4P35916 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FLT4P35916 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FLT4P35916 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FLT4P35916 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FLT4P35916 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FLT4P35916 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FLT4P35916 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FLT4P35916 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FLT4P35916 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FLT4P35916 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FLT4P35916 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FLT4P35916 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FLT4P35916 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FLT4P35916 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms