Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
THBS4P35443 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
THBS4P35443 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
THBS4P35443 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
THBS4P35443 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
THBS4P35443 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
THBS4P35443 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
THBS4P35443 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
THBS4P35443 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
THBS4P35443 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
THBS4P35443 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
THBS4P35443 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
THBS4P35443 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
THBS4P35443 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
THBS4P35443 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
THBS4P35443 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
THBS4P35443 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
THBS4P35443 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
THBS4P35443 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
THBS4P35443 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
THBS4P35443 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
THBS4P35443 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
THBS4P35443 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
THBS4P35443 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
THBS4P35443 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
THBS4P35443 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
THBS4P35443 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
THBS4P35443 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
THBS4P35443 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
THBS4P35443 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
THBS4P35443 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
THBS4P35443 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
THBS4P35443 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
THBS4P35443 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
THBS4P35443 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
THBS4P35443 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
THBS4P35443 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
THBS4P35443 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THBS4P35443 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THBS4P35443 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THBS4P35443 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
THBS4P35443 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
THBS4P35443 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
THBS4P35443 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THBS4P35443 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THBS4P35443 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THBS4P35443 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THBS4P35443 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
THBS4P35443 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
THBS4P35443 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
THBS4P35443 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
THBS4P35443 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
THBS4P35443 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
THBS4P35443 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THBS4P35443 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
THBS4P35443 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
THBS4P35443 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
THBS4P35443 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
THBS4P35443 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THBS4P35443 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THBS4P35443 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THBS4P35443 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
THBS4P35443 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
THBS4P35443 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
THBS4P35443 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
THBS4P35443 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
THBS4P35443 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
THBS4P35443 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
THBS4P35443 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
THBS4P35443 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
THBS4P35443 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
THBS4P35443 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
THBS4P35443 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
THBS4P35443 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms