Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms