Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB2P29033 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB2P29033 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB2P29033 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB2P29033 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB2P29033 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB2P29033 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB2P29033 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB2P29033 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB2P29033 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB2P29033 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB2P29033 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB2P29033 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB2P29033 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB2P29033 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB2P29033 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB2P29033 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB2P29033 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB2P29033 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB2P29033 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB2P29033 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB2P29033 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB2P29033 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB2P29033 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB2P29033 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB2P29033 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB2P29033 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB2P29033 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB2P29033 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB2P29033 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB2P29033 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB2P29033 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB2P29033 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB2P29033 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB2P29033 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB2P29033 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB2P29033 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB2P29033 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB2P29033 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB2P29033 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB2P29033 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB2P29033 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB2P29033 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB2P29033 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB2P29033 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB2P29033 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB2P29033 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB2P29033 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB2P29033 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB2P29033 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB2P29033 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB2P29033 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB2P29033 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB2P29033 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB2P29033 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB2P29033 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB2P29033 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB2P29033 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB2P29033 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB2P29033 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB2P29033 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB2P29033 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB2P29033 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB2P29033 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB2P29033 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB2P29033 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB2P29033 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB2P29033 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB2P29033 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB2P29033 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB2P29033 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB2P29033 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB2P29033 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB2P29033 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB2P29033 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms