Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD34P28906 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD34P28906 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD34P28906 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms