Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KDELR1P24390 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms