Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms