Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCSHP14314 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms