Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXD8P13378 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms