Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FCER1AP12319 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms