Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms