Protein–RNA interactions for Protein: P0C879

Putative uncharacterized protein FLJ43185, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C879 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C879 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C879 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C879 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C879 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C879 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C879 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C879 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C879 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C879 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C879 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C879 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C879 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C879 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C879 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C879 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C879 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0C879 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0C879 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0C879 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0C879 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms