Protein–RNA interactions for Protein: P05000

IFNW1, Interferon omega-1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNW1P05000 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNW1P05000 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms