Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms