Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms