Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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KIF4AO95239 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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