Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSO75390 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSO75390 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSO75390 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSO75390 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSO75390 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSO75390 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSO75390 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSO75390 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSO75390 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSO75390 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSO75390 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSO75390 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSO75390 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSO75390 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSO75390 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSO75390 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSO75390 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSO75390 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSO75390 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSO75390 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CSO75390 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSO75390 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSO75390 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSO75390 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSO75390 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSO75390 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CSO75390 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSO75390 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSO75390 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSO75390 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSO75390 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CSO75390 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSO75390 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSO75390 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CSO75390 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSO75390 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CSO75390 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSO75390 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSO75390 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSO75390 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSO75390 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSO75390 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSO75390 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSO75390 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSO75390 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms