Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA5O60264 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms