Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SOCS3O14543 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SOCS3O14543 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SOCS3O14543 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SOCS3O14543 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SOCS3O14543 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SOCS3O14543 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SOCS3O14543 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SOCS3O14543 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SOCS3O14543 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SOCS3O14543 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SOCS3O14543 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SOCS3O14543 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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