Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CFAP73A6NFT4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CFAP73A6NFT4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CFAP73A6NFT4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CFAP73A6NFT4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CFAP73A6NFT4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CFAP73A6NFT4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CFAP73A6NFT4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CFAP73A6NFT4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CFAP73A6NFT4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CFAP73A6NFT4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CFAP73A6NFT4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CFAP73A6NFT4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CFAP73A6NFT4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CFAP73A6NFT4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CFAP73A6NFT4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
CFAP73A6NFT4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CFAP73A6NFT4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CFAP73A6NFT4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CFAP73A6NFT4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CFAP73A6NFT4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CFAP73A6NFT4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms