Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms