Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms