Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPDC1A2A3K4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms