Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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