Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AAMDC-203ENST00000525034 511 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC079363.1-201ENST00000551366 1125 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL136139.1-201ENST00000605568 222 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 7SK.12-201ENST00000612820 244 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR8075-201ENST00000614354 80 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 Metazoa_SRP.108-201ENST00000621610 300 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 CWF19L1-201ENST00000354105 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 MYH1-201ENST00000226207 6024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 GYG2-209ENST00000639373 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC026124.1-201ENST00000545709 3457 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 BTBD9-201ENST00000314100 8486 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 PER3-202ENST00000377532 6279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 TBCK-203ENST00000394706 3349 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD13C-202ENST00000370944 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 DZANK1-203ENST00000357236 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 DTL-206ENST00000542077 4471 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM237-203ENST00000409883 5415 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 RGPD2-201ENST00000398146 6931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZSCAN25-204ENST00000394152 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 MEG3-220ENST00000522771 6984 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 OR2B11-203ENST00000641527 4545 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC14A2-201ENST00000255226 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADAMTS20-201ENST00000389420 6076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDE4D-208ENST00000502484 2478 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRDM15-202ENST00000398548 6654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 CPNE8-201ENST00000331366 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 THSD7B-203ENST00000413152 5846 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHF6-204ENST00000370803 4489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF781-201ENST00000358582 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZMYND8-217ENST00000536340 5273 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 GABRP-201ENST00000265294 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL121835.2-201ENST00000624253 3502 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPATCH11-202ENST00000409774 3906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 ITGA10-204ENST00000539363 4735 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTBP3-203ENST00000343327 2755 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 SORCS1-202ENST00000344440 3009 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 LPAR6-202ENST00000378434 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 ODF2-220ENST00000604420 3030 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTHFR-203ENST00000376585 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 CARD8-216ENST00000520153 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC104083.1-201ENST00000569449 2615 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011453.1-201ENST00000597619 2239 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 POGZ-203ENST00000368863 6054 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 MFSD8-227ENST00000641393 4069 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 GIGYF2-202ENST00000409196 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 TOGARAM1-201ENST00000361462 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNX13-203ENST00000428135 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 NCAM1-221ENST00000615112 5967 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC11A2-202ENST00000262052 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 HAUS2-201ENST00000260372 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 UCA1-201ENST00000397381 2299 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 DROSHA-202ENST00000442743 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 PMS2CL-204ENST00000486256 3327 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD164-203ENST00000324953 2936 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 ALPK1-205ENST00000504176 5203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 BMX-202ENST00000348343 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC016747.1-201ENST00000420918 2532 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC108451.1-201ENST00000558208 2520 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 IL6ST-206ENST00000381298 9057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AOAH-208ENST00000612871 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms