Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 SEMA6A-201ENST00000257414 4256 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AL049543.1-201ENST00000499525 2874 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AC105760.1-201ENST00000244820 2231 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 LINC01761-201ENST00000424943 2755 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 LCN2-201ENST00000277480 822 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 PFDN5-203ENST00000351500 478 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AC109638.1-201ENST00000417406 326 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 RN7SL149P-201ENST00000465197 281 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 RN7SL35P-201ENST00000466169 292 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AP002802.1-201ENST00000526154 342 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 PFDN5-211ENST00000550846 392 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 MIR4314-201ENST00000583321 92 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AC091810.1-201ENST00000603131 325 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AC079456.1-201ENST00000624010 480 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 OR10G8-202ENST00000641224 1033 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AL035696.3-201ENST00000580119 2050 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 ZFP30-202ENST00000392144 3916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 ZNF410-224ENST00000615736 1551 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 SULT1C2P1-201ENST00000427208 1875 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AC005863.1-201ENST00000379640 2998 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 SMIM19-204ENST00000438528 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 LINC02504-201ENST00000512241 4949 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 UBE2D3-208ENST00000394803 2227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 C11orf45-201ENST00000310799 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 NUP188-201ENST00000372577 5689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 ATP2B2-201ENST00000352432 8593 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 SLC9A6-213ENST00000637234 4691 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 YME1L1-209ENST00000613434 4127 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 ZSCAN9-204ENST00000527436 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 NONO-201ENST00000276079 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 CPA4-202ENST00000445470 2718 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 SMPD4-201ENST00000351288 3661 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 LINC01232-204ENST00000626729 2796 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 ZBTB18-202ENST00000622512 3740 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 GREB1L-201ENST00000269218 5600 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 LAMA3-201ENST00000269217 5671 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 MRPS31P5-201ENST00000416599 3494 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 EXOC2-201ENST00000230449 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 UPP2-201ENST00000005756 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 RNA5SP29-201ENST00000410988 106 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AC112493.1-202ENST00000436019 673 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AC007547.2-201ENST00000468802 360 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 RN7SL65P-201ENST00000485221 315 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 LRRC75A-AS1-220ENST00000579473 585 ntTSL 4 BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AL136985.2-201ENST00000607372 535 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 SNCA-212ENST00000611107 297 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 TRIM39-202ENST00000376659 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 ZNF30-204ENST00000601142 2280 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 ALDH1A2-202ENST00000347587 3297 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 POLR3G-201ENST00000399107 3285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 MACF1-234ENST00000641012 4284 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 TMEM168-206ENST00000454074 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 PLRG1-201ENST00000302078 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 LINC01721-201ENST00000457274 2376 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 GRB10-209ENST00000406641 2700 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 CLDN18-202ENST00000343735 3434 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 SS18-203ENST00000415083 3414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AL590666.3-201ENST00000441272 4122 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 ARID4A-201ENST00000348476 5562 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 PDCL-201ENST00000259467 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 SCML1-202ENST00000380043 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 ASNSD1-201ENST00000260952 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 ANKRD6-213ENST00000520793 2489 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 NLRP1-203ENST00000345221 4656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 NLRP1-217ENST00000619223 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
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