Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PELI1-201ENST00000358912 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF3D-201ENST00000216190 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC107892.1-201ENST00000577382 2727 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP24A1-201ENST00000216862 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CPEB3-202ENST00000412050 7664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP7B-201ENST00000242839 6638 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RAP2C-205ENST00000620646 3341 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC020904.2-201ENST00000621646 1669 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CKAP2L-201ENST00000302450 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FGF5-201ENST00000312465 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHB15-201ENST00000231173 4017 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CUL1-202ENST00000409469 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZCCHC9-201ENST00000254037 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PUS7-201ENST00000356362 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1G-204ENST00000359106 7648 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PGPEP1-202ENST00000269919 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRK2-202ENST00000343742 4740 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF322-202ENST00000456172 4718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF217-210ENST00000521654 11325 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ERCC2-204ENST00000391945 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RBSN-201ENST00000253699 6678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 HPS1-201ENST00000325103 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC144NL-AS1-207ENST00000577537 3727 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KCTD7-211ENST00000640851 3745 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP3CB-204ENST00000394829 3149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087741.1-201ENST00000570309 4399 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP85-210ENST00000579298 1890 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MAX-202ENST00000284165 3155 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CHCHD5-201ENST00000324913 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FUNDC2P1-201ENST00000327891 570 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP93-201ENST00000363838 309 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 VSTM1-202ENST00000366170 654 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT8P40-201ENST00000392131 563 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TDGF1P4-201ENST00000401555 520 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP5G1P8-201ENST00000416294 294 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLVIVOR22-2-201ENST00000430579 330 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 Z93242.2-201ENST00000445666 394 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087385.2-201ENST00000477729 498 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL801P-201ENST00000479462 302 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL36P16-201ENST00000496996 306 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC108516.2-201ENST00000508163 349 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC103719.1-201ENST00000517994 581 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TAGLN2P1-201ENST00000524097 587 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.3 ms