Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LPAR1-202ENST00000374430 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXO4-202ENST00000374259 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SWT1-202ENST00000367501 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FCN1-202ENST00000616356 4369 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 VGLL4-201ENST00000273038 3725 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MMGT1-201ENST00000305963 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIA2-201ENST00000264426 3445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX24-205ENST00000555054 2769 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 POU3F4-201ENST00000373200 3878 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MED23-202ENST00000368053 2811 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ADH6-203ENST00000394899 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LARS2-202ENST00000414984 2800 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB1-203ENST00000554015 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 XIRP1-202ENST00000396251 6040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TSPAN9-206ENST00000537971 4284 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJB14-205ENST00000442697 6075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 COG6-204ENST00000455146 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPV3-201ENST00000301365 3235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ENOX2-203ENST00000370935 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHB6-201ENST00000231136 3266 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ENPP2-203ENST00000427067 3271 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 OTOF-205ENST00000403946 6937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 COG7-201ENST00000307149 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005358.2-201ENST00000584772 3679 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MFSD8-218ENST00000641186 4448 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL031123.2-201ENST00000563225 3325 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NID2-201ENST00000216286 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP8A1-201ENST00000264449 8209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DCAF8-202ENST00000368073 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SNX13-202ENST00000409604 4146 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHB7-201ENST00000231137 3765 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL022323.2-201ENST00000623239 3000 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SEMA6D-201ENST00000316364 6099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 STAT1-212ENST00000540176 4216 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC16A12-201ENST00000371790 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PAPLN-208ENST00000555445 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms