Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 PTCH1-206ENST00000421141 7659 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC8A3-210ENST00000534137 2837 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 IQGAP3-201ENST00000361170 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SIRT5-204ENST00000397350 4382 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AC092329.4-202ENST00000638174 1989 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SPATA3-AS1-201ENST00000414876 3508 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00909-202ENST00000580048 3463 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SELP-206ENST00000458599 1945 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 RAB43-204ENST00000393307 4203 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CEP63-202ENST00000337090 5632 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 C14orf159-204ENST00000428926 2538 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TSPAN2-202ENST00000369516 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ULBP1-201ENST00000229708 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AC100827.4-201ENST00000563464 2441 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF599-201ENST00000329285 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CD44-206ENST00000415148 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PPP6R3-204ENST00000393801 5069 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SORBS2-231ENST00000449407 3049 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TOR1AIP1-208ENST00000528443 3685 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AC114811.2-201ENST00000569927 5647 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ARFGAP2-205ENST00000524782 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC12A3-202ENST00000438926 5567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ADGRE1-201ENST00000250572 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 EDAR-201ENST00000258443 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 LUARIS-201ENST00000436105 2916 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 WDR47-203ENST00000369962 4199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CYLD-214ENST00000569418 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 DDX56-204ENST00000431640 1554 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TXNDC2-202ENST00000357775 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 HAUS6-202ENST00000380502 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SEC16A-206ENST00000431893 6465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SMARCE1-202ENST00000348513 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 STRADA-230ENST00000638702 2140 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 EPS15L1-214ENST00000602009 3915 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TIMELESS-203ENST00000553532 5121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 UAP1-203ENST00000367925 2069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ACSL6-212ENST00000431707 2060 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms