Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN6Q9Y6Q1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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