Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms