Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms