Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms